同年二月十七日，康熙皇帝得知兰州城陷落，一面命大将军贝勒董额、将罕阿密达等统领大兵分路速进，恢复秦州(今甘肃天水)、平凉，一面密令张勇及三位总兵率兵前来夹攻。张勇亲自领兵下河州、洮州，进取巩昌(陇西)为南路兵；王进宝领兵攻兰州，为西路兵；陈福自宁夏南下恢复花马池、定边等地，为北路兵。加上董额等东路的兵力，对王辅臣取四面包围之势。孙思克策应各路并兼领凉州(今甘肃武威)、甘州(今甘肃张掖)。
自是年二月至六月，仅用五个月时间，除王辅臣盘踞的平凉及其附近的固原之外，其余失地相继收复，三边渐趋稳定。康熙皇帝令绿营官兵自成一军，独立作战，或以独立、平等地位与满军联合作战，提高了绿营官兵的地位，使绿营官兵的智慧和力量得到了充分发挥，因而取得了骄人的战绩。
大将军董额因袭旧习，不尊重张勇的功绩。康熙皇帝察觉，曾告诫董额：将军张勇劳绩甚多，不要藐视，以免引起愤懑。张勇对董额的态度甚为敏感，因而一再向康熙皇帝表示不愿与董额合攻平凉府；这时董额也无力解决平凉府问题。康熙十五年(1676)二月初一，康熙接尚可喜奏报，知广东形势危急，考虑万一广东失守，必加重江西战场的军事压力，因而急欲解决陕西问题，以抽调兵力支援江西、湖广，便在是年二月初十日任命都统大学士图海为抚远大将军，率军急赴陕西，总辖全省满汉官兵，断贼饷道，剿灭平(凉)、固(原)逆孽，速靖地方。图海肩负重任，踏上征途，根据康熙重用绿营兵的政策，组织满洲兵与绿营兵以基本平等的地位联合作战。图海于是年五月十七日至平凉，在城北的虎山墩击败王辅臣所部断其饷道之后，立即派参议道周昌(字培公)入城招抚。同年六月十五日，王辅臣率众来降，固原、庆阳等地相继归附。康熙皇帝以宽大为怀，复王辅臣原职，加太子太保，擢靖寇将军，命其立功赎罪。