随着健康的每况愈下，李世民对于金石丹药和长生不老术的兴趣日益高涨，此后，在生命的最后四年，从贞观二十年到贞观二十三年，关于李世民服食金石丹药的记载一直不绝于书。
一位来自天竺的胡僧，则疑似成了李世民暴毙的间接凶手。
由于在生命中的最后几年长期服用丹药，这使得李世民的身体日益虚弱。贞观二十一年（647年），王玄策率众出使天竺，并率领1200名吐蕃兵和7000名泥婆罗（今尼泊尔）骑兵大破中天竺，并俘虏了一位自称已有200岁、懂得长生不老术的天竺方士那逻迩娑婆寐献给了李世民。
对于李世民的直接死因，唐高宗李治在位时的东台侍郎郝处俊说：“昔贞观末年，先帝（李世民）令婆罗门僧那逻迩娑婆寐依其本国旧方合长生不老药……历年而成。先帝服之，竟无异效，大渐之际，名医莫知所为。”后来，唐宪宗时的朝臣李藩也说：“文皇帝（李世民）服胡僧长生药，遂致暴疾不救。”
在服用天竺方士那逻迩娑婆寐进献的长生不老药前，为了保证获取神效，贞观二十三年四月，李世民还特地来到位处终南山上的翠微宫。没想到服用这个长生不老药后，最终却暴毙在终南山上。
但临终之际，李世民仍然不忘玩弄权术。由于担心儿子李治无法慑服名将李勣，临终前，他为儿子李治留下一个秘计说：“李勣才智过人，但是你对他没有恩典，恐怕不能让他信服。现在我会将他贬黜到外地，如果他马上出发赴任，等我死后，你就将他恢复提拔为仆射（宰相）进行重用；如果他徘徊观望，那你就直接将他杀了！”